filogenética

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ViPR, Virus Pathogen ResourceVirus Pathogen Resource, es una base de datos pública patrocinada por el NIAID (National Institute of Allergy and Infectious Diseases) que apoya la investigación de patógenos virales con categoría de prioridad A-C y de aquellos que causan enfermedades infecciosas emergentes y reemergentes. Esta base de datos integra información de fuentes externas (GenBank, UniProt, Immune Epitope Database, Protein Data Bank, etc.) con colaboraciones recibidas directamente. Ver más…

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Bioinformática y genomaEl drástico aumento en el número de coronavirus descubiertos y de genomas de coronavirus que se han secuenciando, constituye una oportunidad sin precedentes para realizar análisis genómicos y bioinformáticos de esta familia de virus. Tradicionalmente, los virus se caracterizaron y clasificaron por cultivo, microscopía electrónica y estudios serológicos. Usando estos métodos fenotípicos, los coronavirus se definieron como virus envueltos de 120-160 nm de diámetro con una apariencia de corona. Ver más…

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DromedariosLos cuatro coronavirus humanos (HCoV) existentes son patógenos respiratorios globalmente endémicos. Estos, junto con los más conocidos rinovirus, son responsables de causar los resfriados comunes. El coronavirus del síndrome respiratorio del Oriente Medio (MERS-CoV) es un virus emergente con una fuente zoonótica conocida en los dromedarios.

Poco se sabe sobre los orígenes de los HCoV endémicos. El estudio de la historia evolutiva de estos virus podría proporcionar una visión importante sobre la aparición del CoV del MERS. Ver más…

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Recombinación genéticaLa evidencia genética y epidemiológica indica que los camellos sirven como reservorio para el coronavirus del MERS pero el mecanismo de la transmisión entre especies aún no es clara y quedan muchas preguntas sobre la susceptibilidad de los humanos a la infección. Ver más…

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En este trabajo se identificaron tres genotipos diferentes del MERS-CoV en Riyadh, Arabia Saudita. Análisis filogeográficos sugieren que el reservorio zoonótico del MERS-CoV se encuentra geográficamente disperso en el área. Ver más…

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En este momento el origen exacto de la causa del síndrome respiratorio agudo severo (SRAS) sigue siendo una incógnita. En este trabajo fue estudiada la relación de la secuencia genómica del SARS-CoV con 30 diferentes virus de ARN (ssRNA) monocatenario de varias familias, usando dos enfoques no estándares. Ambos enfoques se iniciaron con el perfilado vectorial del patrón V de uso del tetranucleótido para cada virus. Ver más…

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El SARS había estado circulando en otras ciudades de la provincia de Guangdong durante unos 2 meses antes de causar un brote importante en Guangzhou, capital de la provincia. Un nuevo coronavirus, SARS coronavirus (CoV), fue aislado de las muestras de tres pacientes con SARS. Ver más…