filogenética

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Una investigación desarrollada por la Facultad de Medicina de la Universidad de Santiago de Compostela (USC) y por el Instituto de Investigaciones Sanitarias (IDIS), ha permitido constatar que España ha sido un caso especial en la propagación de la pandemia, ya que además de las primeras cepas del virus que afectaron a casi toda Europa, al país ibérico llegó también “una cepa asiática que apenas entró en ningún otro país europeo”. Ver más…

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laboratorio virologíaEl brote actual de infecciones del tracto respiratorio inferior, incluido el síndrome de dificultad respiratoria, es la tercera propagación, en solo dos décadas, de un coronavirus animal en humanos que resulta en una epidemia importante. Ver más…

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09-CoVAunque 2019-nCoV es similar a algunos betacoronavirus detectados en murciélagos, es distinto al SARS-CoV y al MERS-CoV. Los tres coronavirus 2019-nCoV aislados en Wuhan, junto con dos cepas similares al SRAS-CoV derivadas de murciélagos (ZC45 y ZXC21), forman un clado distinto en el linaje B del  subgénero sarbecovirus. Las cepas de SARS-CoV de humanos y los coronavirus de murciélagos genéticamente similares al SARS-CoV recolectados del suroeste de China, formaron otro clado dentro del subgénero sarbecovirus. Ver más…

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Bioinformática y genomaEn este trabajo se evalua la variación genética en el síndrome respiratorio del Medio Oriente coronavirus (MERS-CoV) importado a Corea del Sur en 2018 con muestras de un paciente y aislados de células Caco-2 infectadas. La cepa MERS-CoV en este estudio fue genéticamente similar a una cepa aislada en Riyadh, Arabia Saudita, en 2017. Ver más…

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Taxonomía de la familia CoronaviridaeTaxonomía de la familia Coronaviridae según el Comité Internacional de Taxonomía de Virus. En la imagen se muestra el árbol filogenético de 50 coronavirus con secuencias nucleotídicas parciales de ARN polimerasa dependiente de ARN. El árbol fue construido por el método de unión de vecinos utilizando MEGA 5.0. La barra de escala indica el número estimado de sustituciones por 20 nucleótidos.

Fuente: Chan, J. F. W., Lau, S. K. P., To, K. K. W., Cheng, V. C. C., Woo, P. C. Y., & Yuen, K.-Y. (2015). Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus: Another Zoonotic Betacoronavirus Causing SARS-Like Disease. Clinical Microbiology Reviews, 28(2), 465–522. http://doi.org/10.1128/CMR.00102-14

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Murciélago de herradura de ChinaDesde 2005, se ha detectado una gran cantidad de coronavirus relacionados con el SRAS (SRASr-CoV) en los murciélagos de herradura en diferentes áreas de China. Sin embargo, estos coronavirus de murciélagos relacionados con el SRAS muestran diferencias de secuencia con el coronavirus del SRAS en diferentes genes (S, ORF8, ORF3, etc.) y se considera poco probable que representen al progenitor directo de este patógeno. Ver más…

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Relaciones filogenéticas de la subfamilia CoronavirinaeEsta imagen muestra un árbol de vecinos cercanos con raíces a partir de las alineaciones de secuencia de aminoácidos de los dominios conservados a nivel de toda la familia Coronaviridae de la poliproteína replicasa 1  para 21 coronavirus, cada uno de los cuales es un representante de una especie de coronavirus conocida actualmente.

Vea la imagen. Acceda al libro y al capítulo.

Fuente: Mandell, Douglas y Bennett. Enfermedades infecciosas. Principios y práctica. Capítulo 157 – Coronavirus, incluido el síndrome respiratorio agudo grave (SRAG) y el síndrome respiratorio de Oriente Medio (SROM). McIntosh, Kenneth; Perlman, Stanley. Publicado January 1, 2016. Páginas 2030-2038.