Modelo de reconocimiento resonante aplicado a la interacción entre proteínas del SARS-CoV-2 y proteínas humanas

La Revista Cubana de Informática Médica publicó en su número más reciente este estudio que analiza mediante el Modelo de Reconocimiento Resonante (RRM) la posible interacción de las proteínas del SARS-CoV-2 con otras proteínas humanas.

Específicamente, fueron analizadas las replicasas de SARS-CoV-2 y las metiltransferasas para detectar posibles interacciones con las proteínas del receptor CD4 T y las prohibitinas humanas, las cuales participan en la respuesta del organismo humano a las infecciones virales.

Se estudiaron las siguientes secuencias de proteínas: veinte proteínas metiltransferasas del coronavirus del SARS humano, ocho replicasas, veintiuna prohibitinas y once proteínas T4 de antígenos de superficie de células T CD4.

Los resultados revelaron picos de RRM en f1 = 0.07349 y f2 = 0.2839. El pico en f1 también fue común para la interacción entre las metiltransferasas del SARS-CoV-2 y las prohibitinas humanas, donde la fase opuesta sugiere la unión entre estas proteínas durante la infección viral. Esta interacción no fue apoyada para la metiltransferasa viral y los receptores CD4 humanos (cambio de fase de 72,4 o). Las réplicas virales exhibieron una interacción de fase opuesta tanto con las prohibitinas como con los receptores CD4.

En general, el análisis de RRM reveló frecuencias comunes de RRM para replicasas y metiltransferasas, y apoyó plausibilidad de las interacciones entre la metiltransferasa de SARS-CoV-2 y la prohibitina humana, así como entre la replicasa del coronavirus con la prohibitina humana y los receptores de células T CD4.

Vea el texto completo en idioma inglés:

Montesino Castillo S, Yera Gálvez C, Hernández Cáceres JL. Resonant Recognition Model Study for Interactions between SARS CoV 2 and Human Proteins. Revista Cubana de Informática Médica [revista en Internet]. 2020;1(1):[aprox. 0 p.]