Caracterización genética del síndrome respiratorio de Oriente Medio Coronavirus. Corea del Sur – 2018

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Bioinformática y genomaEn este trabajo se evalua la variación genética en el síndrome respiratorio del Medio Oriente coronavirus (MERS-CoV) importado a Corea del Sur en 2018 con muestras de un paciente y aislados de células Caco-2 infectadas. La cepa MERS-CoV en este estudio fue genéticamente similar a una cepa aislada en Riyadh, Arabia Saudita, en 2017.

Un análisis genético comparativo de 157 cepas aisladas en 27 países, incluyendo Corea del Sur, demostró que el MERS-CoV importado que aislamos mostró la identidad más alta (99.85% –99.90%) con una cepa recientemente aislada en Arabia Saudita en 2017.

Estas cepas diferían en 2 posiciones (C309T y T519C). No detectamos ninguna variación en la NTD ni en la RBD, que son los principales sitios funcionales de la proteína S (11). Además, las cepas involucradas en el brote en Corea del Sur en 2015 tuvieron 12 sustituciones NT, lo que implica que el caso importado en 2018 involucró un virus diferente.

Vea el texto completo.

Chung Y-S, Kim JM, Kim HM, Park KR, Lee A, Lee N-J, et al. Genetic characterization of Middle East respiratory syndrome coronavirus, South Korea, 2018. Emerg Infect Dis. 2019

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