Diseño basado en vacunología inversa de una vacuna universal multiepítope contra el virus chikunguña: Enfoques filogenéticos e inmunoinformáticos

Además del síndrome febril agudo, la infección por chikunguña (CHIKV) puede provocar manifestaciones articulares crónicas que afectan significativamente la calidad de vida a largo plazo. Este estudio tuvo como objetivo diseñar una vacuna candidata universal que cubra todos los genotipos circulantes de CHIKV, basándose en una plataforma multiepítope conservada.

Se empleó un enfoque filogenético e inmunoinformático a gran escala para identificar regiones de marcos de lectura abiertos (ORF2) que codifican proteínas estructurales virales.

Este estudio identificó 10 epítopos de alta calidad: 6 MHC-I, 1 MHC-II y 3 epítopos de células B. Los epítopos seleccionados abarcan múltiples dominios virales, incluyendo C, E1, E2 y E3, con alta inmunogenicidad (VaxiJen ≥ 66 %), propiedades no tóxicas y no alergénicas.

Estos epítopos seleccionados se utilizaron para diseñar constructos de vacuna multiepítopo (MEV-CHIKV) unidos con diversos enlazadores en combinación con adyuvantes (β-defensina 3 humana) para potenciar la respuesta inmunitaria. El análisis de validación estructural mostró alta calidad y estabilidad del constructo de vacuna.

Con base en el análisis de acoplamiento molecular, la vacuna diseñada tiene altas afinidades de unión con el sitio activo de TLR3. La simulación inmunitaria in silico mostró la inducción de robustas respuestas inmunitarias adaptativas, caracterizadas por la activación y expansión de poblaciones de células B y T.

La optimización de codones y el análisis de codones raros revelaron una expresión potencialmente alta en el sistema bacteriano. Por lo tanto, se anticipa que el candidato a vacuna induzca de manera efectiva y simultánea robustas respuestas inmunitarias celulares y humorales. Además, debería conservar su alta protección ante la aparición de nuevas mutaciones en el genoma del CHIKV.

Dado que este estudio se basa únicamente en un análisis in silico, aún se requiere una mayor validación experimental in vitro e in vivo para demostrar y validar las propiedades inmunogénicas de la vacuna candidata.

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Hakim, M.S. Reverse vaccinology-based design of a universal multiepitope vaccine against chikungunya virus: Phylogenetic and immunoinformatics approaches. Sci Rep (2026).