Procedencia de la cepa causante del brote de cólera en Haití
Métodos
Mediante secuenciación de ADN de molécula única en tiempo real de tercera generación determinamos las secuencias genómicas de 2 aislados clínicos de Vibrio cholerae del brote actual de Haití, 1 cepa que causó el cólera en América Latina en 1991, y 2 cepas aisladas del sur de Asia en 2002 y 2008. Utilizando datos de secuenciasprimarias, comparamos los genomas de esas 5 cepas y un conjunto de secuencias genómicas parciales obtenidas previamente de 23 cepas distintas de V. cholerae para determinar la posible procedencia del brote de cólera de Haití.
Resultados
Tanto las variaciones de un solo nucleótido (SNV) como la presencia y estructura de elementos cromosómicos hipervariables indican que existe una estrecha relación entre los aislados haitianos y cepas de la variante V. cholerae El Tor O1 aisladas en Bangladesh en 2002 y 2008. Y por el contrario, el análisis de la variación genómica de los aislados haitianos revela una relación más distante con los aislados circulantes en América del Sur.