Identificación estructural de inhibidores naturales dirigidos a la glicoproteína Gc del virus Oropouche: Un enfoque in silico

El virus Oropouche (OROV), un ortobunyavirus emergente que representa una creciente preocupación para la salud pública en las Américas, actualmente carece de terapias antivirales aprobadas. En este estudio, empleamos un enfoque in silico para identificar estructuras antivirales naturales capaces de dirigirse a la glicoproteína Gc.

Gc es una proteína de fusión de clase II esencial para la fusión de la membrana del huésped y la entrada del virus. Se analizó una biblioteca de 537 compuestos derivados de plantas frente al dominio de cabeza Gc (PDB ID: 6H3X) mediante acoplamiento y reacoplamiento molecular, seguido de simulaciones de dinámica molecular de 100 nanosegundos, cálculos de energía libre MM-PBSA y perfiles ADMET.

La curcumina y la berberina resultaron ser los candidatos más destacados. La curcumina demostró un perfil equilibrado, con una unión estable (−38,14 kcal/mol), una baja RMSD de la cadena principal (1,82 Å) y un radio de giro constante (Rg ~ 18,8 Å), lo que sugiere una fuerte estabilidad conformacional y la compacidad del complejo proteína-ligando.

La berberina exhibió la energía de unión más favorable (−13,10 kcal/mol) y mantuvo la estabilidad dinámica (RMSD 1,86 Å; Rg ~ 19,0 Å), aunque acompañada de una citotoxicidad prevista que podría requerir un refinamiento estructural.

Ambos compuestos indujeron fluctuaciones reducidas en el nivel de residuos (RMSF < 2,5 Å) en regiones funcionalmente críticas de la proteína Gc, en consonancia con un mecanismo de acción que implica la estabilización de la conformación de prefusión y la interferencia con las transiciones estructurales necesarias para la entrada viral.

Estos hallazgos identifican a la curcumina y la berberina como andamiajes prometedores para el desarrollo de fármacos anti-OROV y ofrecen una base racional para una futura validación experimental dirigida a los mecanismos de fusión viral.

Lea el artículo completo en:

Vargas-Echeverría C, Saurith-Coronell O, Rodriguez-Macías J, Márquez Brazón EA, Mora JR, Fuentes-Gandara F, Paz JL, Salazar F. Structure-Based Identification of Natural Inhibitors Targeting the Gc Glycoprotein of Oropouche Virus: An In Silico Approach. Int J Mol Sci. 2025 Oct 30;26(21):10541. doi: 10.3390/ijms262110541.