En este estudio se analizaron conjuntos de datos de secuenciación del genoma completo de 6321 individuos japoneses, incluidos pacientes con enfermedades autoinmunes -psoriasis vulgar, artritis reumatoide (AR), lupus eritematoso sistémico (LES), proteinosis alveolar pulmonar (PAP) o esclerosis múltiple- y enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), o controles sanos.

Se cuantificaron sistemáticamente dos componentes del viroma ADN sanguíneo, el HHV-6 endógeno (eHHV-6) y el anellovirus.

Los participantes con eHHV-6B (subtipo B) tenían mayores riesgos de LES y PAP; el primero fue validado en All of Us. La positividad de eHHV-6B y las puntuaciones altas del índice de actividad de la enfermedad de LES tuvieron fuertes correlaciones. El estudio de asociación de todo el genoma y la secuenciación de lectura larga mapearon la integración del genoma de HHV-6B a un locus en el cromosoma 22q. El mapeo de epítopos y la secuenciación de ARN de una sola célula revelaron una inducción inmunitaria distintiva por eHHV-6B en pacientes con LES.

Además, la alta carga de anellovirus se correlacionó fuertemente con el estado de LES, AR y COVID-19. Estos análisis revelan relaciones entre el viroma humano y las enfermedades autoinmunes e infecciosas.

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Sasa, N., Kojima, S., Koide, R. et al. Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19. Nat Genet 57, 65–79 (2025).