Como especifica la política actual de SAGE de la OMS, los programas de vacunación deben continuar para completar la serie primaria y la(s) dosis(es) de refuerzo para los grupos de prioridad media y alta.

Además, la Estrategia Mundial de Vacunación contra la COVID-19 de la OMS, publicada en julio de 2022, también exige vacunas con mayor durabilidad y amplitud de protección.

Las actualizaciones de la composición del antígeno de la vacuna pueden mejorar las respuestas inmunitarias inducidas por la vacuna a las variantes circulantes del SARS-CoV-2, de acuerdo con la declaración anterior de TAG-CO-VAC publicada en junio de 2022.

A partir de mayo de 2023, los linajes descendientes de XBB.1 predominan en la circulación del SARS-CoV-2 a nivel mundial. Para mejorar la protección, en particular contra la enfermedad sintomática, las nuevas formulaciones de vacunas contra la COVID-19 deben apuntar a inducir respuestas de anticuerpos que neutralicen los linajes descendientes de XBB.

Un enfoque recomendado por TAG-CO-VAC es el uso de un linaje descendiente XBB.1 monovalente, como XBB.1.5 como antígeno de la vacuna. Dadas las pequeñas diferencias genéticas y antigénicas de XBB.1.5, XBB.1.16 puede ser una alternativa. Los antígenos de pico de estos dos linajes están relacionados genética y antigénicamente muy de cerca, con solo dos diferencias de aminoácidos entre XBB.1.5 y XBB.1.16 (E180V y T478R).

Se pueden considerar otras formulaciones y/o plataformas que logren respuestas sólidas de anticuerpos neutralizantes contra los linajes descendientes de XBB.

Si bien las vacunas COVID-19 actualmente aprobadas, incluidas las basadas en el virus índice, continúan brindando protección contra enfermedades graves, el TAG-CO-VAC recomienda alejarse de la inclusión del virus índice en futuras formulaciones de vacunas COVID-19.

Esto se basa en las siguientes razones:

• el virus índice y las variantes estrechamente relacionadas desde el punto de vista antigénico ya no circulan en humanos;
• el antígeno del virus índice provoca niveles indetectables o muy bajos de anticuerpos neutralizantes contra las variantes del SARS-CoV-2 que circulan actualmente, incluidos los linajes descendientes de XBB;
• la inclusión del virus índice en las vacunas bivalentes o multivalentes reduce la concentración de los nuevos antígenos diana en comparación con las vacunas monovalentes, lo que puede disminuir la magnitud de la respuesta inmunitaria humoral;
• y la impronta inmunitaria debida a la exposición repetida al virus índice puede reducir las respuestas inmunitarias a nuevos antígenos diana.

Otros requisitos de datos y consideraciones

Dadas las limitaciones de la evidencia sobre la que se derivan las recomendaciones anteriores y que se espera que continúe la evolución del virus, el TAG-CO-VAC recomienda encarecidamente la generación de datos sobre las respuestas inmunitarias y los criterios clínicos de valoración en humanos que reciben una prueba de COVID-19 con una composición actualizada, en diferentes plataformas de vacunas, así como más datos sobre el rendimiento de las vacunas COVID-19 actuales contra las variantes circulantes de SARS-CoV-2.

Finalmente, es imperativo que las organizaciones multilaterales, los gobiernos y los fabricantes continúen colaborando para acceder a las vacunas COVID-19 actualmente aprobadas y garantizar el acceso global equitativo a las vacunas con una composición antigénica actualizada a medida que estén disponibles.

Fuente: WHO. News. Statement on the antigen composition of COVID-19 vaccines – 18 mayo 2023

En el presente trabajo se emplean herramientas bioinformáticas para realizar inferencias sobre los hospederos potenciales de SARS-CoV-2, a partir de la comparación de las secuencias de ACE2 entre el humano y otros vertebrados.

Lea el artículo completo.

Serrano-Barrera OR. Análisis filogenético del receptor humano del coronavirus SARS-CoV-2 e implicaciones en la biología de la infección. Rev. electron. Zoilo [Internet]. 2020;45(3):[aprox. 0 p.].

La investigación demostró también la existencia de los llamados “supercontagiadores”, individuos especialmente proclives a la transmisión del SARS-CoV-2 y que de hecho, la transmiten a un mayor número de personas.

Asimismo, los autores de este trabajo han comprobado que la variabilidad genética del coronavirus es la propia de un proceso evolutivo natural, por lo que afirman que “los datos no serían compatibles con las manipulaciones de laboratorio, basadas exclusivamente en ‘teorías de conspiración’ sin argumentos científicos”.

El estudio ha revelado igualmente que, en determinados lugares, estos agentes altamente contagiadores dieron lugar a lo que los genetistas llaman “efectos fundadores locales”, que terminan traduciéndose en brotes epidémicos de alcance variable a nivel local o incluso nacional.

Vea el texto completo.

Fuente: Rusia Today- 21 mayo 2020

El Grupo de Estudio Coronavirus (CSG) del Comité Internacional de Taxonomía de Virus, entidad responsable de desarrollar la clasificación oficial de virus y nombres de taxones (taxonomía) de la familia Coronaviridae, evaluó la novedad del patógeno humano llamado provisionalmente 2019-nCoV.

Basado en la filogenia, la taxonomía y la práctica establecida, el CSG reconoce formalmente este virus como hermano de los coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV), de la especie coronavirus relacionados con síndrome respiratorio agudo severo, y lo designa como el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo ( SARS-CoV-2).

Para facilitar la comunicación, el CSG propone además utilizar la siguiente convención de nomenclatura para aislamientos individuales:

SARS-CoV-2 / Aislado / Huésped / Fecha / Ubicación

Queda por determinar el espectro de manifestaciones clínicas asociadas con infecciones por SARS-CoV-2 en humanos. La transmisión zoonótica independiente de SARS-CoV y SARS-CoV-2 resalta la necesidad de estudiar toda la especie para complementar la investigación centrada en virus patógenos individuales de importancia inmediata.

Esta investigación mejorará nuestra comprensión de las interacciones virus-huésped en un entorno en constante cambio y mejorará nuestra preparación para brotes futuros.

Vea el texto completo.

Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses – a statement of the Coronavirus Study Group. Alexander E. Gorbalenya, Susan C. Baker, Ralph S. Baric, Raoul J. de Groot, Christian Drosten, Anastasia A. Gulyaeva, Bart L. Haagmans, Chris Lauber, Andrey M Leontovich, Benjamin W. Neuman, Dmitry Penzar, Stanley Perlman, Leo L.M. Poon, Dmitry Samborskiy, Igor A. Sidorov, Isabel Sola, John Ziebuhr. bioRxiv 2020.02.07.937862; doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.07.937862

Dado que la identidad de secuencia en dominios de replicasa conservados (ORF 1ab) es inferior al 90% entre 2019-nCoV y otros miembros del género betacoronavirus, el 2019-nCoV, agente causante de la neumonía viral en Wuhan, es un nuevo betacoronavirus perteneciente al subgénero sarbecovirus de la familia Coronaviridae.

Fuente: A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. Na Zhu, Ph.D., Dingyu Zhang, M.D., Wenling Wang, Ph.D., Xinwang Li, M.D., Bo Yang, M.S., Jingdong Song, Ph.D., et al. N Engl J Med. January 24, 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2001017

Un análisis genético comparativo de 157 cepas aisladas en 27 países, incluyendo Corea del Sur, demostró que el MERS-CoV importado que aislamos mostró la identidad más alta (99.85% –99.90%) con una cepa recientemente aislada en Arabia Saudita en 2017.

Estas cepas diferían en 2 posiciones (C309T y T519C). No detectamos ninguna variación en la NTD ni en la RBD, que son los principales sitios funcionales de la proteína S (11). Además, las cepas involucradas en el brote en Corea del Sur en 2015 tuvieron 12 sustituciones NT, lo que implica que el caso importado en 2018 involucró un virus diferente.

Vea el texto completo.

Chung Y-S, Kim JM, Kim HM, Park KR, Lee A, Lee N-J, et al. Genetic characterization of Middle East respiratory syndrome coronavirus, South Korea, 2018. Emerg Infect Dis. 2019

Fuente: Chan, J. F. W., Lau, S. K. P., To, K. K. W., Cheng, V. C. C., Woo, P. C. Y., & Yuen, K.-Y. (2015). Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus: Another Zoonotic Betacoronavirus Causing SARS-Like Disease. Clinical Microbiology Reviews, 28(2), 465–522. http://doi.org/10.1128/CMR.00102-14

En este trabajo se informan los hallazgos de un proyecto de vigilancia de 5 años de SRASr-CoV en una cueva habitada por múltiples especies de murciélagos de herradura en la provincia de Yunnan, China. Los genomas completos de 11 cepas de SRASr-CoV recientemente descubiertas, junto con los hallazgos previos de este estudio, revelan que los SRASr-CoV que circulan en esta única ubicación son muy diversos en el gen S, ORF3 y ORF8. Otro hallazgo sobre el que se informa en este trabajo es el primer descubrimiento de un SRASr-CoV de murciélagos muy similar al SRAS-CoV humano en ORF3b y en los ORF8a y 8b divididos.

Los autores postulan la hipótesis de que el progenitor directo del SRAS-CoV puede haberse originado después de sucesos de recombinación secuencial entre los precursores de estos SRASr-CoV. Los estudios de entrada de células demostraron que tres SRASr-CoV recientemente identificados con diferentes secuencias de proteína S son capaces de usar el ACE2 humano como receptor, y además muestran estrecha relación entre las cepas de esta cueva y el SRAS-CoV.

Este trabajo proporciona nuevos conocimientos sobre el origen y la evolución del SRAS-CoV y destaca la necesidad de la preparación para el futuro surgimiento de enfermedades similares al SRAS.

Vea el texto completo.

Hu B, Zeng L, Yang X, Ge X, Zhang W, Shi Z, et al. Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus. Plos Pathogens. 2017, Nov 30; 13(11): 1-27

Vea la imagen. Acceda al libro y al capítulo.

Fuente: Mandell, Douglas y Bennett. Enfermedades infecciosas. Principios y práctica. Capítulo 157 – Coronavirus, incluido el síndrome respiratorio agudo grave (SRAG) y el síndrome respiratorio de Oriente Medio (SROM). McIntosh, Kenneth; Perlman, Stanley. Publicado January 1, 2016. Páginas 2030-2038.

Un equipo de la Universidad de Columbia y la Universidad de California en Davis entre otras instituciones, utilizaron ensayos basados ​​en PCR, secuenciación dirigida y secuenciación del genoma para perfilar el material viral en muestras de un Pipistrellus cf. hesperidus de Uganda a principios de 2013. Los análisis descubrieron un coronavirus que era casi 87 por ciento idéntico al MERS-CoV y que compartió un 91 por ciento de sus secuencias con un coronavirus de murciélago sudafricano conocido como NeoCoV.

Los esfuerzos dirigidos a la vigilancia mundial de virus emergentes son un componente importante de las iniciativas de prevención de pandemias. La información derivada de estos monitoreos permite obtener datos sobre los factores ecológicos y evolutivos que impulsan la diversidad viral.

Sin embargo, encontrar una secuencia viral no es suficiente para determinar si el virus puede infectar a las personas. En este trabajo se investigó el riesgo zoonótico específico de un coronavirus identificado en un murciélago de Uganda y se demostró que, a pesar de estar estrechamente relacionado con el MERS-CoV, es poco probable que represente una amenaza para los seres humanos.

Los autores sugieren que este enfoque constituya una estrategia adecuada para comenzar a determinar el potencial zoonótico de los virus de la fauna silvestre.

Vea el artículo completo.

Anthony SJ, Gilardi K, Menachery VD, Goldstein T, Ssebide B, Mbabazi R, et al. Further evidence for bats as the evolutionary source of Middle East respiratory syndrome coronavirus. mBio 2017; vol. 8 no. 2 e00373-17