De esta notable y provechosa iniciativa, es pertinente evaluar los resultados que derivaron de modelaciones computacionales, con el empleo de herramientas bioinformáticas, de las moléculas virales y la respuesta inmune humana frente a ellas, en una serie de artículos que aparecieron en la revista entre 2020 y 2022.

En el primero de los trabajos remitidos de esa serie, apenas transcurrido el primer trimestre del año 2020, se llamaba la atención sobre la extensa distribución tisular de uno de los receptores que emplea el virus para infectar sus células diana: la molécula ACE2, según puede observarse en las bases de datos KEGG y GENE. Ello debía ser “un elemento a tener en cuenta en relación con la fisiopatología de la infección por SARS-CoV-2”, y se adelantaba que, por la misma razón, la covid-19 no sería solo una enfermedad respiratoria: el pulmón no está entre los diez primeros órganos con mayor presencia de ACE2.

Vea el texto completo en:

Serrano-Barrera OR, Pérez-Martin O, Góngora-Parra KB. Covid-19, de las predicciones bioinformáticas a las evidencias clínico-epidemiológicas. Rev. electron. Zoilo [Internet]. 2024; 49 (1) .

Con brotes y epidemias recientes, los patógenos son una amenaza constante para la economía y la seguridad mundiales. Las plagas relacionadas con virus son de alguna manera las más difíciles de manejar. La biocomputación ha proporcionado una ayuda apreciable para resolver problemas relacionados con la virología clínica.

Esta revisión, por primera vez, examina el estado actual del papel de la computación en la investigación relacionada con virus. Se han discutido los avances realizados en los campos de virología clínica, el diseño de medicamentos antivirales, la inmunología y la oncología viral, a través de aportes de biocomputación.

El gran progreso alcanzado y las plataformas de software disponibles se consolidan en esta revisión. Se presentan también las limitaciones de los métodos basados ​​en computación. Finalmente, se especula sobre los desafíos que enfrenta el futuro de la biocomputación en virología clínica.

Vea el artículo completo.

The unequivocal preponderance of biocomputation in clinical virology. Sechul Chun, Manikandan Muthu, Judy Gopal, Diby Paul, Doo Hwan Kim, Enkhtaivan Gansukh and Vimala Anthonydhason. RSC Adv., 2018, 8, 17334-17345

La invención y los avances en tecnologías de amplificación de ácidos nucleicos, secuenciación automatizada de ADN y herramientas bioinformáticas en las últimas dos décadas, han revolucionado la caracterización y clasificación de todo tipo de agentes de enfermedades infecciosas. Utilizando métodos moleculares, los coronavirus se clasificaron como virus de ARN monocatenario de sentido positivo.Además, los resultados de la utilización de métodos filogenéticos para la clasificación también ayudó a definir los límites del grupo de la clasificación antigénica tradicional.

Los coronavirus poseen los genomas más grandes entre todos los virus de ARN conocidos (26,4 a 31,7 kb). Filogenéticamente, existen tres géneros: Alphacoronavirus, Betacoronavirus y Gammacoronavirus, más los subgrupos A, B, C y D del género Betacoronavirus. Recién se identificó un cuarto género emergente, Deltacoronavirus, que incluye el coronavirus bulbul HKU11, el coronavirus HKU12 y el coronavirus HKU13 de munia. El análisis molecular  reveló que el momento del ancestro común más reciente del coronavirus relacionado con el SRAS humano/civeta fue 1999-2002.

Según este estudio, la recombinación en los coronavirus fue más notable entre las diferentes cepas del virus de la hepatitis murina (MHV), entre diferentes cepas del virus de la bronquitis infecciosa, entre MHV y el coronavirus bovino, entre el coronavirus felino (FCoV) tipo I y el coronavirus canino generando FCoV tipo II, y entre tres genotipos de coronavirus humano HKU1 (HCoV-HKU1).

Bajo este nuevo sistema de clasificación, los coronavirus de los murciélagos dominan los géneros Alphacoronavirus y Betacoronavirus y los coronavirus de los pájaros dominan los géneros Gammacoronavirus y Deltacoronavirus. Esta enorme diversidad de coronavirus en murciélagos y aves los ha convertido en excelentes reservas genéticas para coronavirus en estos cuatro géneros.

Si bien este estudio se desarrolló y publicó antes de la aparición del coronavirus del MERS, proponemos su lectura por los interesantes hallazgos en materia de filogenética que aporta al conocimiento de este género.

Ver artículo completo.

Woo PCY, Huang Y, Lau SKP, Yuen K-Y. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010;2(8):1804-1820. doi:10.3390/v2081803.